Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms