Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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USP34Q70CQ2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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USP34Q70CQ2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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USP34Q70CQ2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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USP34Q70CQ2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP34Q70CQ2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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