Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms