Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF549Q6P9A3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms