Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms