Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms