Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms