Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms