Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDSS1Q5T2R2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDSS1Q5T2R2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms