Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A3Q5K4L6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms