Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms