Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSP90AA4PQ58FG1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms