Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms