Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms