Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms