Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRFIP1Q32MZ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRFIP1Q32MZ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms