Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms