Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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