Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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