Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SYPL1Q16563 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SYPL1Q16563 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SYPL1Q16563 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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