Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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