Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USF2Q15853 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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