Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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