Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EEA1Q15075 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EEA1Q15075 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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