Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGRF1Q13972 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms