Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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