Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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