Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms