Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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