Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms