Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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