Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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