Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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KCNMA1Q12791 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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KCNMA1Q12791 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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KCNMA1Q12791 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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KCNMA1Q12791 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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KCNMA1Q12791 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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