Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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