Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms