Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIGFQ07326 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIGFQ07326 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIGFQ07326 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIGFQ07326 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms