Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBQ06643 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms