Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPB1Q06547 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms