Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms