Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms