Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLE4Q04727 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms