Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC4Q03721 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC4Q03721 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms