Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBX1P83916 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX1P83916 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX1P83916 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms