Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS28P62857 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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