Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms