Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIK1P57059 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK1P57059 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK1P57059 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIK1P57059 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK1P57059 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK1P57059 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK1P57059 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms