Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms