Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms