Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX2P52951 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms