Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCR4P51679 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCR4P51679 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms